Jenomže Neo není všelék, ale jenom nástroj pro udržení funkčnosti Matrixu.

Pokud si pamatuješ na scénu z metra, kde Neo potkal indickou rodinku, existují i jiné části světa strojů a jejich implementace pro lidský mozek je stejná jako Matrix, nebo se tak dá použít. Nevidím důvod, proč by měl Neo vidět mezistanici stejně, jako Matrix (nebo alespoň tak, jak to bylo viditelné pro nás).
Pokud to je tak, pak veškerý živý kód ve světě strojů se dá implementovat jako bytosti a frameworky pak jako prostředí a vizualizace se řeší pak na úrovni blízké mozku. Za Matrixem tedy leží pravděpodobně oddělené světy, kde například mohou být i lidé, kteří nemají problém se stroji spolupracovat, nebo jsou vystaveni nějaké simulaci.
Matrix tedy pravděpodobně bude vězením pro nepřizpůsobivé rebely, kterým se jednou za čas podstrčí revoluce. Neo potom bude prostě program, jak bylo nadhozeno, a každá jeho generace bude vyvolána ze zálohy.

Ale můžeme jít ještě dál - sám jsi to nadhodil. Co když onen svět samotný je simulací? On totiž ty podmínky splňuje. Máme omezený svět s jasnou historií, ze kterého nejde uniknout. Je v něm katastrofa a lidi se snaží přežít, takže staví bunkry, vymýšlejí vznášedla, robotické systémy, plasmové zbraně, EMP...
Docela rád bych takový servřík vlastnil