Hehe, tyhle programy bohužel neznám a k ffmpeg mám nějaký pravděpodobně iracionální odpor. (něčím mě pravděpodobně tenhle kodek pohoršil, stejně jako VLC player, které mě na disk nesmí.)

Používám:
Pokud nelze vytáhnout z videa formát AC3,wav tento odkaz: konvertor
Na synchronizaci zvuku: Gold Wave
Na snímkování: Eac3
na konvertování z wav do AC3: Wav to AC3 encoder
A klasiku: MKVTool